|
|
Accession Number |
TCMCG053C24276 |
gbkey |
CDS |
Protein Id |
XP_034218463.1 |
Location |
complement(join(23660368..23660442,23660818..23660886,23661313..23661390,23661535..23661601,23661729..23661833,23661958..23662499,23662594..23662802,23663380..23664010,23664109..23664160,23664611..23666584,23666729..23667948,23668335..23669447,23669800..23669859)) |
Gene |
LOC117629907 |
GeneID |
117629907 |
Organism |
Prunus dulcis |
|
|
Length |
2064aa |
Molecule type |
protein |
Topology |
linear |
Data_file_division |
PLN |
dblink |
BioProject:PRJNA631757 |
db_source |
XM_034362572.1
|
Definition |
E3 ubiquitin-protein ligase PRT6 [Prunus dulcis] |
CDS: ATGGAAGTCGATTCGCCTCCTGAAATTACACCGCTCAGGCCTCGTGATCGAATCATACGGAGGCTTGCTCTATTGGGAGTGCCTGAGGAGTTTCTTGATCAGTTCCAACGTGGGTTAGTTGCTTTTGTCAAAAAGAACAAGCAACGGATACCAGAGCTAGTTTCTGCTATATTACCTGCTGATGAGGAAGTAGCAGAAGTTCTAAATGAAGCTAAACCGGGGTCTAAAAAACAATCAGCAGCAGTAACCATGAAAAATCGATTCCGTGAAAGCATGGTGTGGTTACAGTGGTTGATGTTTGAGGGTGAACCTTCTTCAGCCCTGAAGAATCTCTCCAAAATGAGTGTTGGGCAGCGTGGTGTTTGTGGAGCTGTTTGGGGGCAGAATGATATAGCATACAGGTGCCGAACATGTGAACATGACCCAACGTGTGCAATTTGCGTTCCGTGTTTTCAGAATGGGAATCACAAGGATCATGATTATTCTGTTATTTATACTGGCGGTGGTTGTTGTGATTGTGGTGATGTTACAGCATGGAAGCGCGAAGGCTTTTGCTCAAAGCATAAAGGTACAGAACAGATACAACCCCTTCCAGAGGAGTTTGCAAACATTGTGGGGCCTGTTCTTGATTGTGTCTTCGTTTCTTGGAAAAATAAGCTACTTCTTGCGGAAACTACCTACCGGGAAACCCCTAGAGCAAGCGACCATGTGACAGAGCGTAAGAAGGTTGCAAATGAGTTAACTTTTGTTGTGGTTGAGATGCTTCTAGACTTCTGCAAATACAGTGAAAGTTTGCTGAGTTTTGTATCTAAGATGATTTTATCATCAGGGGATTTATTGGGGATTCTTGTGAGGGCAGAGAGGTTTCTGACTGAAGCTGTTGTGAAAAAGCTCCATGAGTTGCTCCTGAAATTGCTGGGGGAACCTATTTTCAAGTATGAGTTCGCCAAAGTATTTTTGTGTTATTACCCAGCCGTTGTAAGTGAAGCCAGAATGGAATTCAGTGACATTTCTTTAAAAAAGTATCCGCTGCTCTCTGTATTCTCAGTACAAATCTTCACAGTGCCAACTTTAACACCCCGTCTTGTGAAAGAAATGAACCTACTGCCTATGCTGATGGGATGCTTGCAAGATATTTTCGTTTCCTGTGCTGGTGATGACGGTCGTTTACAGGTTACCAAGTGGTCAAATTTGTATGAGATCACTGTTCGTGTCATTGAAGATATTCGATTTGTTATGAGCCATGCTGTAGTGCCCAAATATGTAACTCATGACAAGCAAGATATTTCAAGATCTTGGATGAGACTGTTGACTTTTGTGCAAGGGATGAATCCACAAAAAAGGGAAACAGGCATCCGCATCGAAGAAGAAAATGAGAGTATGCATCTGCCATTCGTTCTAGGCCATTCAATTGCCAACATTCATTCTCTATTGGTGGATGGGGCATTTTCTGTGGCTAGCGACAAGATGGATGAAGACTTGCAGGATATGGATGGCAGGGATAGCCTAAGACATGCAAAAGTAGGACGGTTGTCCCCGGAAAGTTCCGTATGCAGTGCAGTGGGGAGGAGTAGTTCATTTGCATGTGCATCGAAGGTTTCAGAAGATAAATCAGACGCGCTTTCTGATTTGTTGATTCCACCATCTGTGATGTGGCTAACCTATGAGTGCTTGAGGGCCATTGAGAATTGGCTGGGAGTTGATAATACCTCCGGGGCTTTTCTTGATGCATCTTCTCCAAGTACTAGCAATTTCTCAGGTAGCAATTTTTCAGCACTGAAGAAAACATTGTCCAAGATCAGGAGAGGCAATATATTTGGTAGACTTGCCAGTTCAAGTGAAGATCATGGCAAGCAATGTTCATCGCATTTACATAGTGATTGCAATATGAGTGTTGACTTCCAGAATGGTAAAGGTGCTGGCCAGGAAACTAAATTAATGGTTCCCGACGAAATTGATTCAGTTAATGCATGTAGTCCTGCAGGATTTGATGATAGTGCCATGGAAGTAGATGGTGCCATGGACTTAGATGCTTTACGTGTTCTGAGTTCGTCGGATTGGCCAGACATAACATATGACATTAGTTCGCAGGATATATCTGTTCACATTCCTTTACATCGGTTACTTTCCTTGCTTTTGCAGAAAGCATTGAGAAGATGTTTTGGTGAAGTGCCAGATTTGGCTAGTGCTACTTCTGCAAATTCATCTTCAGCTATTTTGACTGACTTCTTTGGAAATTTTCTAGGAGGCTGCCACCCATATGGATTTTCTGCCTTTGTTATGGAGCATCCCCTTCGGATCAGAGTATTTTGTGCTGAGGTTCATGCTGGAATATGGCGGAAAAATGGGGATGCTGCCCTATTATCATGTGAGTGGTATCGTTCAGTTCGCTGGTCTGAACAGGGTTTGGAGCTTGACCTGTTTCTGCTTCAGTGCTGTGCTGCCTTGGCTCCAGCTGATCTTTATGTTAATAGAATTGTAAAACGCTTTGGTCTGTCAAGCTACCTTTCTTTGAACCTTGAGCGCTCAAGTGAATATGAAGCAGTTTTAGTGCAGGAGATGCTAACTCTTATTATACAAATAGTCAAAGAAAGGAGATTTTGTGGGCTAACTAAAGCTGAAAGTTTGAAAAGAGAGTTAATTCATAAATTAGCCATTGCAGATGCCACTCATAGTCAATTGGTTAAATCTCTTCCTCGTGATCTGTCTAAGTTTGATCAGCTTCCTGAAATTTTGGATACTGTTGCGGCATATTCCAATCCCTCTGGCTTTAATCAAGGGATGTATTCACTACGATGGACATTTTGGAAAGAAATGGATTTGTTCTACCCTCGTTGGAACTCAAGGGATCTGCAAGCTGCAGAAGAAAGATACTTGCGTTTCCGTAGCGTTTCTGCATTGACCACTCAGCTACCGAGGTGGACTGAGATTTATCCTCCTTTCAAGGGGGTTGCTAGAATAGCCACTTCTAAAGCAGTCCTTCAAATTATCCGTGCAGTGCTGTTTTATGCTATTTTTTCTGATAAATCAATTGATTCGCGAGCTCCTGATGGTGTTCTTTTAACTGCATTGCACTTACTGTCATTAGCATTAGACATTTGTTTTCAACATAAGGAATCTGGTGATCAGTCTTGTTATGATGGAGATGTAATTCCCATACTAGCTTTTGCTGGTGAAGAAATTTATGAAGGACCACATTTTGGCGCTGGCCAACAAAGCTTGTTGTCACTTCTTGTGATCTTGATGAGGATGCATAAGAAAGAGAATTTAGACAATTGTTTGGAAACTGGGAGTGACCTCTCTTCTTTAATTGGAAGCTTATTGAAGAAGTTTGCAGAGATCGATTCGGGATGTATGACCAAACTGCAACTACTTGCACCTGAAGTAATTGGTCATGTATTACAATCTTCTCCAAATGGTGACACATATACCTCGGGTTCAATTTCTGACTCTGAGAAGCGCAAGGCAAAAGCCAGAGAGAGACAGGCTGCCATTTTGGAAAAAATGAGAGCCGAGCAATTGAAATTTATGGCTAGCGTTAATTCCACTGTGGATGATGCCTCAAAATCTGAGCAAGAGGTTTGTAACCCTGACGTTGAAGATGATTCAGAAGAGTCTGCAGAAGTTGTTTGCTCACTTTGCCATGATCCCAATTCCAGAAATCCCATATCCTACTTAGTTCTTCTTCAGAAATCTAGGCTTTTGAATTTCATGGACAGAGGTCCCCTTTCATGGGAACAACCTCGCTGGATAGACAAGGAGCACATGTCTATTATCAAAGGTGAGGTGACTGATCAATCTGAAACAAGCTCTTCGTCAGGTGGTTCAGGGGTGGTACCATCTTACCCTTTAAAACAGTTGGTTCAGGATGCAATCACCGAATTTGCCTGTCATGGGCAACCTAGGGATGTTGAGGCTCTTCTAGATTTTTTCAAGGGCCGGTTCCATGAATTAAAGAATATCCAAGTGCCACGTGAATTAAATGATGAAAGTGAAAAGACTTTATGTACATTTGAGACAATGGAAGACGCCATGTACCTCTCCATCCAAAAAGAATTGCATGATAAGATGCTGCATTCTAAGCTTACAGAGGATAAGGGATTTTCAACTCCTGAAAGGGATCAAGAAAAAACTGAGCATGCTGAATTTATGTTGCTTGGGAAATATATAGCTGCTCTTTCTAGAGAGACAACAGAAAATCCTTCATCCTCTGAAAGTCCCAATGAAAAGGTGCCAATAGATTCTTCTCGGCTTTCAGCGTATGATGGATTTGGCCCGATGGATTGTGATGGAATTTATCTTTCTTCCTGTGGGCATGCTGTGCATCAGGGATGCCTTGATCGCTATTTATCTTCACTGAAGGAAAGGTATCTCAGAAGAATTGTTTTTGAAGGAGGACATATTGTAGATCCAGATAAGGGGGAGTTTCTCTGCCCTGTATGCCGTCGACTTGCAAATTCTGTGTTGCCTGCGTTGCCAGGGTTGTTCGAGAAGGTCTCGAAGGAGTCTCTGCATTCAGGTGTTAGTTCATCACATGCTACTGGTCCATTGGTCAAATCAGGTGGAGAAATTAATTCTCTTCAGCTTCAGCAAGGCTTGGCTCTTGTGCAATCTGCCGCAAAGGCATCTGGGAAGGTTGGAAATCTTAAAGGTTTTCCCCTGCAGAGATGTGGAAGAATGACCTCAAACCTTGAAATTTCCCGTTTGCTCTGTAAGATATATTTTCCGACTAAACAGGATAAGTTATCAGGGTCTGCCAGGGTCAGCCACCCAATGCTCATGTGGGACACAATTAAGTACTCCCTATTATCAATTGAAATTGCTGCACGTTCTGGCGGGAAATATGCAACACCAAGCTATGACCTTAATGCATTGTATAAGGAACTTGAATCCTCGAGTAGATTTGTATTGTCTTTGTTGCTGAAAGTAGTCCAAAGCAAAAGTAAGAATTCTCTTCATGTGCTTCAGAGATTTATAGGAATTCAGAGCTTTGCAGAATCTATTTGCTTTGGAGTTTCCATAGACCATGGTAGCGAAACATGTGGACAAGGGGCCATGTTGCGTATCTTGGAACATGTTGATATGGCGGTATCATATCCTGATATTCAGTTCTGGAATAGAGCATCTGATCCTGTCCTTGCTCGTGATCCTTTTTCATCATTGATGTGGGTTCTTTTTTGTCTTCCAAACCGGTTTTTATCATGTGAAGATTCCCTGTTATCCCTGGTGCACTTATTCTATGTTGTCTCTGTAGTTCAGGGTATAATTGCATATCTTGGGAAAAATCAATGCGATATGAGTAAATTAGGTGTTGATGATTGTCTGGTTACCGACGTCTCTAAACTCATGGGAGAATCTGGATGCCCGCAGCAATATTTTGTTTCAAACTATGTTGGCTCTTCTTGTAACAGTAATATTAAGAACATAGTTCGTAGCTTGAGTTTCCCTTATTTGCGGAGGTGTGCATTGCTGTTGAATTTACTAAACTATAATGCCCAATCACCATTCTTCGAAAGGTATAATGTGTTGGATAGATCTCATGACATTGGTGACATGATGGATACCACTTATGTGGCGCTGGTAGAGCTCAATGAAGTTCAGGAGATAGAAAGAATGTTCAAGATTCCTAAACTTGATGTTATTCTTAAGGATAAAGTGGTGCGTTCAATGGTTCAGAAATGGTTCCGTCATTTTTGCAAGGAGTTTGAAGTCCAAAGATTTAGAGGAAGCATACACTGTAATCCTGCAGTTCCCTTCCAGTTGATGCGTCTGCCCCGAGTTTACCAGGACCTTTTGCAGAGGTATATTAAACAGCGTTGTCCTGATTGCAAATCCATCCTTGAGGACCCCGCATTGTGCCTGCTTTGTGGGAGATTATGCTCTCCAAGCTGGAAGTCATGCTGCCGGGAAAGTGGATGCCAAACTCATGCATTGGCCTGTGGTTCTGGTACTGGGGTATTTCTGTTGATCAGGAGGACAACAATTCTGCTACAAAGATGTGCGCGGCAAGCTCCCTGGCCATCACCGTACTTGGATGCTTTTGGGGAAGAGGATGTTGAAATGCAAAGAGGAAAGCCGCTGTACTTGAATGACGAACGCTATGCAGCTTTAACTTATTTGGTTGCTTCTCATGGTCTTGATCAAAGTTCCAAGGTTCTTGGGCAAACTACTATTGGTTCTTTCTTCATGGTTTAG |
Protein: MEVDSPPEITPLRPRDRIIRRLALLGVPEEFLDQFQRGLVAFVKKNKQRIPELVSAILPADEEVAEVLNEAKPGSKKQSAAVTMKNRFRESMVWLQWLMFEGEPSSALKNLSKMSVGQRGVCGAVWGQNDIAYRCRTCEHDPTCAICVPCFQNGNHKDHDYSVIYTGGGCCDCGDVTAWKREGFCSKHKGTEQIQPLPEEFANIVGPVLDCVFVSWKNKLLLAETTYRETPRASDHVTERKKVANELTFVVVEMLLDFCKYSESLLSFVSKMILSSGDLLGILVRAERFLTEAVVKKLHELLLKLLGEPIFKYEFAKVFLCYYPAVVSEARMEFSDISLKKYPLLSVFSVQIFTVPTLTPRLVKEMNLLPMLMGCLQDIFVSCAGDDGRLQVTKWSNLYEITVRVIEDIRFVMSHAVVPKYVTHDKQDISRSWMRLLTFVQGMNPQKRETGIRIEEENESMHLPFVLGHSIANIHSLLVDGAFSVASDKMDEDLQDMDGRDSLRHAKVGRLSPESSVCSAVGRSSSFACASKVSEDKSDALSDLLIPPSVMWLTYECLRAIENWLGVDNTSGAFLDASSPSTSNFSGSNFSALKKTLSKIRRGNIFGRLASSSEDHGKQCSSHLHSDCNMSVDFQNGKGAGQETKLMVPDEIDSVNACSPAGFDDSAMEVDGAMDLDALRVLSSSDWPDITYDISSQDISVHIPLHRLLSLLLQKALRRCFGEVPDLASATSANSSSAILTDFFGNFLGGCHPYGFSAFVMEHPLRIRVFCAEVHAGIWRKNGDAALLSCEWYRSVRWSEQGLELDLFLLQCCAALAPADLYVNRIVKRFGLSSYLSLNLERSSEYEAVLVQEMLTLIIQIVKERRFCGLTKAESLKRELIHKLAIADATHSQLVKSLPRDLSKFDQLPEILDTVAAYSNPSGFNQGMYSLRWTFWKEMDLFYPRWNSRDLQAAEERYLRFRSVSALTTQLPRWTEIYPPFKGVARIATSKAVLQIIRAVLFYAIFSDKSIDSRAPDGVLLTALHLLSLALDICFQHKESGDQSCYDGDVIPILAFAGEEIYEGPHFGAGQQSLLSLLVILMRMHKKENLDNCLETGSDLSSLIGSLLKKFAEIDSGCMTKLQLLAPEVIGHVLQSSPNGDTYTSGSISDSEKRKAKARERQAAILEKMRAEQLKFMASVNSTVDDASKSEQEVCNPDVEDDSEESAEVVCSLCHDPNSRNPISYLVLLQKSRLLNFMDRGPLSWEQPRWIDKEHMSIIKGEVTDQSETSSSSGGSGVVPSYPLKQLVQDAITEFACHGQPRDVEALLDFFKGRFHELKNIQVPRELNDESEKTLCTFETMEDAMYLSIQKELHDKMLHSKLTEDKGFSTPERDQEKTEHAEFMLLGKYIAALSRETTENPSSSESPNEKVPIDSSRLSAYDGFGPMDCDGIYLSSCGHAVHQGCLDRYLSSLKERYLRRIVFEGGHIVDPDKGEFLCPVCRRLANSVLPALPGLFEKVSKESLHSGVSSSHATGPLVKSGGEINSLQLQQGLALVQSAAKASGKVGNLKGFPLQRCGRMTSNLEISRLLCKIYFPTKQDKLSGSARVSHPMLMWDTIKYSLLSIEIAARSGGKYATPSYDLNALYKELESSSRFVLSLLLKVVQSKSKNSLHVLQRFIGIQSFAESICFGVSIDHGSETCGQGAMLRILEHVDMAVSYPDIQFWNRASDPVLARDPFSSLMWVLFCLPNRFLSCEDSLLSLVHLFYVVSVVQGIIAYLGKNQCDMSKLGVDDCLVTDVSKLMGESGCPQQYFVSNYVGSSCNSNIKNIVRSLSFPYLRRCALLLNLLNYNAQSPFFERYNVLDRSHDIGDMMDTTYVALVELNEVQEIERMFKIPKLDVILKDKVVRSMVQKWFRHFCKEFEVQRFRGSIHCNPAVPFQLMRLPRVYQDLLQRYIKQRCPDCKSILEDPALCLLCGRLCSPSWKSCCRESGCQTHALACGSGTGVFLLIRRTTILLQRCARQAPWPSPYLDAFGEEDVEMQRGKPLYLNDERYAALTYLVASHGLDQSSKVLGQTTIGSFFMV |